国宝级的极品玉璋已被摔碎，不可一势的日本人倒地不起，接下来的工作就是中日双方重新谈判。最终的结果是日本方面针对这次重大损毁文物事故给予了经济赔偿。这次事件之后，与日本方面的合作仍在友好与愉快的气氛中继续进行，双方都在耐心与默契地等待三星堆博物馆开馆之后，中国的文化瑰宝敲开日本博物馆大门的那一天。
当与日本方面的纠葛与前期合作暂告一个段落之后，时间已到了1997年的10月。此时的三星堆博物馆一切布置妥当，真正是万事俱备，只欠东风。这个“东风”当然就是两个祭祀坑出土的文物。但尽管广汉方面派出博物馆的人员在省政府、文化厅、考古研究所三方之间来回穿梭，但毫无成果。而攻击的重中之重——省考古研究所，却如同一块巨型橡皮一样不软不硬。整个考古研究所从领导到专家再到修复文物的技工，在涉及文物时要么相互推诿，要么装聋作哑，没有半点交出的意思。在焦急与无奈中，广汉方面高层领导决定一方面从考古研究所发表的资料中寻找突破口。凡是在公开或内部报刊、书籍、音像制品中发表的器物资料，全部进行登记造册，并在册后附上原文。在向省政府递交报告和当面陈述时，就以这份登记册和所附的原文为准，以便利用大家都看得见摸得着、实实在在的铁证，堵住考古研究所领导那整日放言“正在整理之中”的嘴巴。另一方面，向省考古研究所保证，只要对方交出文物，每年可享受博物馆门票收入20%的分红，以用于文物的修复和今后三星堆遗址的继续发掘和研究。