京畿、长城驻防线，康熙亲政后，于长城沿线增设归化城（呼和浩特）、喜峰口、冷口、罗文峪、山海关和山西右卫驻防点。山海关和张家口也提高规格，各设总管，各口普遍增加防御数额，充实了兵力。在京畿地区则增设了滦州、霸州、玉田、宝抵、雄县、永平府等驻防点。
沿运河、黄河驻防线。从北京经德州、京口至杭州的运河驻防线在顺治年间已完成，目的在于保障漕运路线的畅通，康熙年间进一步加强。从德州经开封至西安的黄河驻防线完成较晚，直到康熙五十七年（1718年）五月，康熙鉴于河南地接六省，战略地位十分重要，主动提出派兵驻防问题，始由兵部等衙门研究决定，派八旗满洲、蒙古马兵六百人、鸟枪兵二百名驻扎开封，设城守尉一人，满洲佐领、防御、骁骑校各八人，蒙古佐领、防御、骁骑校各二人。
长江驻防线是在军事征伐过程中完成的。顺治年间曾于南京、镇江设将军率兵驻防，长江中上游则没有设防，顺治十二年曾考虑设武昌驻防，终因扰驿累民作罢。康熙元年，都察院左都御史魏裔介曾建议在荆州设满洲驻防，认为驻防的优势在于“无事则控扼形势，以销奸宄之萌；有事而提兵应援，可以据水陆之胜”，但被部议否决。“三藩”叛乱平定后，荆州的地位受到康熙的重视，乃于二十年十二月决定设置荆州驻防，二十二年任命了将军、副都统，调拨官兵，完成驻防布置。同时对江宁驻防也充实了力量。康熙六十年六月西藏军务结束后，又根据五十七年设置成都驻防的决定，命法喀为副都统，率满洲兵1600名常驻成都。