谈判在混乱的情况下，断断续续地谈了四年。在这段时间里还发生了印第安人暴动（人们相信这些暴动是英国间谍煽动的结果）、英国“抓壮丁”队与美国船长之间激战不止，加上美国国内出现重大的政治动荡。一个新的、咄咄逼人的政党应运而生，这就是所谓的“青年共和党”。麦迪逊政府所处的时代并不是美国建国之父们所梦想的那种和平与温馨的时代。
最终，宗主国和前殖民地之间的战争爆发了。这场战争让那些对萨拉托加和约克郡的光荣岁月仍然记忆犹新的人们，经历了许多不愉快的时刻。
各个州之间也出现了激烈的冲突。当乔治·华盛顿统率军队的时候就曾经非常强烈地抱怨新英格兰人，说他们“唯利是图”，“缺乏爱国主义精神”。现在，新英格兰人再次表明他们是与众不同的。
禁运令和中止通商法令对他们来说毫无作用。从普利茅斯殖民地刚开始建立的时候，他们就一直从事走私活动。所以他们不费吹灰之力就可以逃避国会所采取的禁止与英国和法国通商的措施。但是，一旦英、美两国宣战，那么他们就不得不停止他们的非法活动了，他们也开始考虑国内的情况了。他们对南方和西部邻居提出强烈的指责，说他们没有任何正当理由就把国家拖入了一场战争之中。他们的报纸要求拒绝执行联邦的命令。在哈特福德举行的一次会议上，来自新英格兰各州的代表制订了一项完整的计划，他们决定成立一个独立的新英格兰邦联。