他提倡的似乎是更高级的道德：“用宗教发起信心，增进国民的道德”（《东京留学生欢迎，会演说辞》），他倡导佛学，讲的正是佛入地狱的道德精神和众生平等的道德理想，他肯定墨子的“兼爱”和苦身劳形以忧天下的道德，“非命之说，为翠家所独胜”，可惜“亦仅持之有故，未能言之成理”。
由此，他讲革命，也立足于道德：“且道德之为用，非特革命而已，事有易于革命者，而无道德亦不可成就”（《革命之道德》）。把道德当做革命与进步的动力与目标了。
所以，他对进化论的改造，则改造为俱分进化论，不是生物进化而是社会心理和意识，才是社会进步的原动力，也就是说，道德为第一推动力，以至干他的史籍中充满道德评价。
现在，我们来看他描绘出的由道德所左右的历史发展的画面吧：
彼不悟进化之所以为进化者，非由一方直进，而必由双方并进，专举一方，帷言知识进化可尔。若以道德言，则善亦进化，恶亦进化；若以生计言，则乐亦进化，苦亦进化也。双方并进，如影之随形，如周两之逐景，非有他也。知识愈高， 虽欲举一废一而不可得。（《俱分进化沦》）
他以人为例，由动物至人，固然是进化，但人的道德却比虎豹要坏，虎豹不食同类，人却处处相食，相互残杀。那么，人与虎豹，轨进化？退化？在人类历史上，“聚磨之丑、争食之情，又无时或息”。